Solexa Library Primer Sequences

Sequences for Solexa Library Preparations: 

Oligonucleotide sequences © 2006 and 2008 Illumina, Inc. All rights reserved. 

Genomic DNA/ChIP-Seq oligonucleotide sequences 

Adapters1  

5'  P-GATCGGAAGAGCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG  

5'  ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT   

PCR Primers1  

5' AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT 

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGAGCTCTTCCGATCT   

Genomic DNA Sequencing Primer  

5' ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT 

 

Paired End DNA oligonucleotide sequences 

PE Adapters1 

5'  P-GATCGGAAGAGCGGTTCAGCAGGAATGCCGAG 

5'  ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT 

PE PCR Primers1  

5' AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT 

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATCGGTCTCGGCATTCCTGCTGAACCGCTCTTCCGATCT 

PE Sequencing Primer  

5' ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT 

5' CGGTCTCGGCATTCCTGCTGAACCGCTCTTCCGATCT 

DpnII gene expression oligonucleotide sequences 

Gex Adapter 1             

5' P-GATCGTCGGACTGTAGAACTCTGAAC 

5’ ACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGAC 

Gex Adapter 2  

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGANN 

5' P-TCGTATGCCGTCTTCTGCTTG 

Gex PCR Primer 1  

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGA 

Gex PCR Primer 2  

5' AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA 

Gex Sequencing Primer  

5' CGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC 

 

NlaIII gene expression oligonucleotide sequences 

Gex Adapter 1  

5' P-TCGGACTGTAGAACTCTGAAC 

5' ACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACATG  

Gex Adapter 2  

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGANN 

5' P-TCGTATGCCGTCTTCTGCTTG   

Gex PCR Primer 1  

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGA  

Gex PCR Primer 2  

5' AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA  

Gex Sequencing Primer  

5' CCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACATG 

Small RNA oligonucleotide sequences 

RT Primer  

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGA 

5' RNA Adapter   

5' GUUCAGAGUUCUACAGUCCGACGAUC  

3' RNA Adapter   

5' P-UCGUAUGCCGUCUUCUGCUUGUidT 

Small RNA PCR Primer 1  

5' CAAGCAGAAGACGGCATACGA  

Small RNA PCR Primer 2  

5' AATGATACGGCGACCACCGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGA  

Small RNA Sequencing Primer  

5' CGACAGGTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATC 

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